上海有三所副部级大学，分别是复旦大学、上海交通大学和同济大学。所谓“副部级大学”其实是中管高校的俗称。因为这31所大学的校长、党委书记为副部级，列入中央管理的干部序列。而其他的大学，校长、党委书记是正局级，由教育部或者所在主管单位、主管省份管理。
这三所大学均是当前国内最顶尖的大学。这些高校的校长、书记等高层领导由中共中央、中央组织部联合任命，而非通常由国家部委或省级人民政府任命。是中华人民共和国教育部直属、中央直管副部级建制的全国重点大学，世界一流大学建设高校，国家“985工程”、“211工程”重点建设高校。
这三所大学的党委书记、校长职务均列入《中共中央管理的干部职务名称表》，为中管干部，中管高校党委书记、校长均为副部长级。回顾历史，1992年，全国确定了首批14所副部级大学，包括北京大学、清华大学、中国人民大学、北京师范大学、北京理工大学、北京航空航天大学、中国农业大学、北京医科大学（2000年与北大合并）、中国科学技术大学、复旦大学、上海交通大学、西安交通大学、哈尔滨工业大学、西北工业大学。
哪些大学是副部级
副部级全国重点大学，很多，一共31所。大部分985院校都是副部级，只有以下几所不是：华南理工大学。中国海洋大学。东北大学。华东师范大学。湖南大学。电子科技大学。中央民族大学。国防科学技术大学也是985，但是它是由中央军委直属的，是副大军区级编制，不是传统意义上的副部级大学。
