安徽医科大学当前有4个校区，其中2025年10月新医科中心正式启用并成为主校区，其余3个为原有校区。
新医科中心位于合肥市肥西县杭埠河大道2227号，规划总用地2137亩，目前已建成55万平方米。作为新主校区，行政办公和10个学院已整体入驻，现有在校生1.3万人，全部建成后可容纳2.3万人。校区主打智慧校园，构建智慧教学、医疗、管理三大场景安徽医科大学怎么样，聚焦医教研产深度融合，是学校创建“双一流”的重要支点。
这里是全国面积最大的医科院校校区 。这里建筑崭新，校园环境优美，探微楼等科研综合楼外观现代大气 。校区以AI赋能、数字引领，构建了“智慧教学、智慧医疗、智慧管理”三大场景 。校内的公共学习中心，阅读空间宽敞安徽医科大学怎么样物业经理人，馆藏丰富，借阅系统先进；大学生活动中心功能齐全，能开展各类学术、文化活动 。
梅山路校区地处合肥市蜀山区梅山路81号，是学校原本部。这里集中了基础医学院、口腔医学院等多个核心教学科研机构，汇聚临床医学、基础医学等优势学科，周边医疗与交通配套成熟，曾长期承担核心理论教学和基础科研任务。
作为学校的老校区，历史悠久，文化氛围浓厚。这里有藏书丰富的图书馆，以及国家级实验示范中心。校区周边生活设施便利，毗邻安徽医科大学第一附属医院，步行即可到达，且周边有小吃街，能让你品尝到各种美食。此外，校园内的建筑虽略显老旧，但具有独特的风格，还可能有一些见证学校发展的历史遗迹。
翡翠路校区位于合肥市经济技术开发区翡翠路15号，占地187.9亩。该校区是安徽医科大学临床医学院的办学地，校内建有综合办公楼、体育馆、教学楼和学生公寓等完善设施，适配独立学院的教学与生活需求。
东校区坐落于合肥市新站高新技术产业开发区唐河路，校区主要布局生物医学工程学院和生命科学学院，配备充足的图书资源与实验设备，能较好满足相关学科的教学实训和学生的日常学习生活需求。